Press release

ヒト遺伝子変異のデータベース “HGV Database”開設

2014年7月30日

本日、ヒト遺伝子変異の情報を収集するオープンアクセスデータベース、HGV Databaseが開設されました。このデータベースにはオープンアクセスジャーナル Human Genome Variation に掲載されたデータレポート(Data Report)に由来する遺伝子変異のデータが収集され、医療従事者や研究者の情報源として無料公開されます。

世界の様々な地域において確認された変異の情報を整理し収集してゆくことは、人間の疾病や健康についての理解を進めようとする研究者や医師にとり大変有意義なことです。このデータベースでは、利用者は特定の疾患、遺伝子、集団、地域などから遺伝子変異データを検索、絞込むことができます。また、収集されたデータには公開に当たりクリエイティブ・コモンズのライセンス“CC0”が適用されるため、利用者はそのデータを自由に活用することができます。

本データベースはネイチャー・パブリッシング・グループの新たなオープンアクセスジャーナル Human Genome VariationHGV)と、データベースの管理技術を提供するFigshareとの提携により、運営されます。Figshareは、科学研究データの管理および活用を推進する技術を提供する情報技術企業で、既に数多くの出版社や研究機関と連携しています。

データとジャーナルの掲載論文の双方がオープンアクセスで公開されることで、データマイニングやテキストマイニング、そして大規模な系統分析も容易になります。このことは人類遺伝学の分野では非常に重要です。

「HGV Databaseはまだ始まったばかりですが、今後多くの研究者、医師、遺伝カウンセラー、そしてゲノム研究に関心を寄せる方々に活用されることを願っています。Human Genome Variation 誌とFigshareの両者の協力により、データベースの情報や、そこからリンクされた論文にも自由にアクセスしていただけますので、ゲノム研究者のコミュニティにとって重要な情報源として、発展していくことを期待しています」。こう話すのは、Human Genome Variation 編集長である徳永勝士(とくなが かつし)東京大学教授です。

ネイチャー・パブリッシング・グループは、革新的なデジタル学術出版サービスの創出における経験とスキルを活かすために、このプロジェクトでFigshareと提携しました。Figshareの創設者であるMark Hahnel氏は次のように述べています。「このプロジェクトでネイチャー・パブリッシング・グループと提携できたことを誇らしく思います。Figshareは科学コンテンツ普及への道を切り開き、向上させるための新たな方法を常に模索しています。HGV Databaseがゲノム研究者のコミュニティに与える影響に大いに期待しています」。

Human Genome Variation は日本人類遺伝学会との提携により2014年7月に創刊されたオープンアクセスのオンラインジャーナルです。Human Genome Variation の著者は、3種類のクリエイティブ・コモンズ・ライセンスからひとつを選択、適用して論文を出版することができます。人類遺伝学における重要な研究成果や今後の展望を発表する研究論文(Article)や総説(Review Article)のほか、このジャーナルの重要な取り組みとして、新しく発見、特定された疾患を引き起こす遺伝子の変異やその頻度を報告する短報“データレポート”(Data Report)を積極的に受け付け、出版します。データレポートで報告された遺伝子変異の情報はHGV データベースに搭載され、論文との相互リンクをつけて同時に公開されます。データには独自のURL、DOIも付与されます。

Human Genome Variationでデータレポートを出版する際の著者負担費用(Article Processing Charge)は160,000円(2014年は費用免除)です。HGV データベースへの登録は無料で、他のゲノムデータベースへのデポジットも可能です。

※本プレスリリースの原本は英語であり、日本語は参考翻訳です。
英語プレスリリース

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