遺伝学：FinnGenで得られた、十分に表現型解析された隔離集団からの遺伝学的洞察
Nature 613, 7944 doi: 10.1038/s41586-022-05473-8
フィンランド人集団のような隔離集団は、有害な対立遺伝子が少数の低頻度バリアント（マイナー対立遺伝子頻度が0.1％以上5％未満）に集中することが多いため、遺伝学的研究に有益である。これらのバリアントは、多数の極めてまれなバリアントとして分布されることなく、創始者集団のボトルネックを生き延びてきた。この効果はメンデル遺伝学ではよく確立されているが、ありふれた疾患の遺伝学におけるその価値はあまり調べられていない。FinnGenは、フィンランド人50万人のゲノムと国民健康登録データの研究を目的としている。FinnGenは、参加者の年齢の中央値が比較的高く（63歳）、病院での募集がかなりの割合を占めることから、多数の疾患エンドポイントを含んでいる。今回我々は、FinnGenの参加者22万4737人のデータを解析し、大規模なゲノム規模関連解析（GWAS）でこれまでに対象とされた15の疾患について調べた。また、エストニアと英国のバイオバンクデータのメタ解析も行った。その結果、30の新たな関連が特定され、これは主にフィンランド人集団に豊富に見られる低頻度バリアントとの関連であった。1932の疾患に関するGWASからは、807のエンドポイントについて、独立した2496座位での2733のゲノム規模での有意な関連が特定された（フェノーム規模の関連解析〔PheWAS〕では、247のエンドポイントについて、771座位で893のフェノーム規模での有意性〔PWS〕が特定された〔P < 2.6 × 10−11〕）。これらのうち、精細マッピングからは、83（42 PWS）のエンドポイントについて、148（73 PWS）のコーディングバリアントの関連が示唆された。さらに、フィンランド人以外のヨーロッパ人では、91（47 PWS）のバリアントにおいて対立遺伝子頻度が5％未満であり、そのうち62（32 PWS）はフィンランド人で2倍以上頻度が高かった。これらの知見は、ボトルネックが起こった集団が、低頻度で効果の大きいバリアントを通してありふれた疾患の生物学的性質の切り口を探る上で持つ力を実証している。
