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がんゲノミクス:良性組織と悪性組織におけるクローンの空間分解されたコピー数変化
Nature 608, 7922 doi: 10.1038/s41586-022-05023-2
良性組織から悪性組織への移行を定義することは、がんの早期診断を改善するために重要である。今回我々は、系統的な手法を用いて、in situでの空間的なゲノム完全性を調べ、これまでに見つかっていなかったクローン性の関係について報告する。我々は、空間分解トランスクリプトミクスを用いて、複数の器官の良性組織と悪性組織における12万を超える領域で、空間的なコピー数変動を推定した。前立腺に注目した器官規模の手法において、ゲノム規模のコピー数変動は、腫瘍内とその近傍の良性組織で異なるクローンパターンを示すことが実証された。我々の結果は、がん進化の初期事象が起きている可能性があるが組織学的には良性の組織において、ゲノム不安定性がどのように生じるかについてのモデルを示唆している。我々は、分子的および空間的な連続性を組織の状況で捉える検出力を明らかにし、また、局所療法を含む、治療の枠組みの理論的根拠に疑問を呈する。

