分子生物学：コヒーシンの除去によって明らかになったクロマチンの組織化の2つの独立した様式

画像化法や3C（chromosome conformation capture）法による研究から、メガ塩基サイズの活性区画や不活性区画への隔離、メガ塩基以下のドメイン（TAD）への分割など、染色体の組織化のいくつかの層が明らかになっている。しかし、染色体組織化のこれらの層が、形成され、相互作用し、ゲノム機能に影響を及ぼす仕組みは解明されていない。今回我々は、マウス肝臓でコヒーシンを積み込む因子Nipblを欠失させると、染色体の折りたたみの顕著な再組織化につながることを示す。TADや関連Hi-Cピークは、転写の変化がなくても全体的に消失する。対照的に、区画化による隔離は持続し、増強すらされている。際立つ結果として、TADが消失すると、さらに微細な区画構造が明らかになり、これはその下層のエピジェネティックな全体像を正確に反映している。これらの観察から、ゲノムの三次元構造は2つの独立した機構の相互作用から生じることが示された。1つは、コヒーシン非依存的なゲノムの微細区画への隔離で、これはクロマチン状態によって決定される。もう1つは、おそらくループの突出によるコヒーシン依存的なTADの形成で、遠位エンハンサーをその標的遺伝子に誘導するのを助けている。

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