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遺伝:天然の遺伝的変動がエンハンサーの選択および機能に与える影響

Nature 503, 7477 doi: 10.1038/nature12615

遺伝的変動がヌクレオチドレベルで転写調節や表現型に影響を与える機構については完全に解明されていない。本論文では、天然の遺伝的変動をin vivoでの変異誘発スクリーニングとして用い、異なるマウス系統由来の初代培養マクロファージで、細胞系譜決定に関わる転写因子およびシグナル特異的転写因子の結合、エピゲノミクス、および転写の結果に配列変動が与える全ゲノム的影響を評価した。我々は、細胞系譜を決定する転写因子が、協調的にゲノムのエンハンサー様領域を選択し、シグナル依存的因子の結合を促進することにより、エピジェネティックな状態およびトランスクリプトームの状態を決定するという概念を裏付ける重要な遺伝学的証拠を見いだした。この転写因子機能の階層的モデルは、細胞系譜を決定する転写因子および情報源として有益なヒストン修飾についての限定的なゲノムデータセットが、疾患に関連する調節性変異体の優先順位付けに利用できることを示唆している。

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