遺伝：長鎖非コードRNA TINCRによる体細胞組織分化の制御
Nature 493, 7431 doi: 10.1038/nature11661
数千種類に及ぶヒトの長鎖非コードRNA（lncRNA）のうち、いくつかについてはその機能が明らかにされているが、体細胞組織分化でlncRNAがどんな役割を持つかについては、まだほとんどわかっていない。本研究では、3.7キロ塩基のlncRNAであるTINCR （terminal differentiation-induced ncRNA）が、転写後機構によってヒトの上皮分化を制御することを示す。TINCRは主要な分化遺伝子のメッセンジャーRNA（mRNA）量を増やすのに必要で、FLG、LOR、ALOXE3、ALOX12B、ABCA12、CASP14、ELOVL3などの、そうした遺伝子の多くはヒトの皮膚疾患で変異している。TINCRを欠失した上皮では、最終分化した超微細構造であるケラトヒアリン顆粒や、層板小体の完全性などが失われていた。ゲノム規模でのRNAインタラクトーム解析から、TINCRは一連の分化遺伝子mRNAと相互作用することがわかった。TINCRとmRNAの相互作用は、25塩基の「TINCRボックス」モチーフを介して起こる。TINCRボックスは相互作用するmRNAに多く含まれ、TINCRの結合に必要である。ハイスループットスクリーニングにより、約9,400個のヒト組み換えタンパク質に対してTINCR結合能を解析したところ、TINCR RNAがSTAU1（staufen1）タンパク質と直接結合することが明らかになった。STAU1を欠失した組織は、TINCRの欠失で見られる分化異常を再現した。しかし、STAU1を介したRNA分解に必要なUPF1とUPF2を欠失させても、分化への影響はなかった。TINCR–STAU1複合体は、KRT80のような分化遺伝子mRNAの安定性にかかわっているらしい。これらの結果から、TINCRは体細胞組織の分化に必要とされる主要なlncRNAであり、体細胞組織の分化はlncRNAが分化遺伝子mRNAに結合して、その発現を確実にすることによって起こることが明らかになった。
