遺伝学：集団規模の塩基配列解読から持続性EBV DNAの決定因子が解明される
Nature 650, 8102 doi: 10.1038/s41586-025-10020-2
エプスタイン・バーウイルス（EBV）はエンデミック（風土病）を引き起こすヘルペスウイルスであり、自己免疫、がん、神経学的疾患への関与が示唆されている。初回感染は不顕性であることが多いが、EBVの持続感染は、免疫調節異常を駆動し、長期の合併症につながることがある。EBV感染は至る所で見られるにもかかわらず、初回曝露後のEBVの持続性を決定する因子についてはほとんど解明されていないが、ヒトの遺伝的多様性がこの表現型スペクトラムに部分的に関与していることが分かっている。今回我々は、ヒト集団の既存の全ゲノム塩基配列解読（WGS）データを用いることで、持続性EBV DNAを定量化できることを実証する。我々は、英国バイオバンク（n = 49万560）およびAll of Us（n = 24万5394）のWGSと健康記録データを用いて、血液由来のEBV DNAの定量値と、呼吸器疾患、自己免疫疾患、神経学的疾患、心血管疾患の間に再現可能な関連があることを明らかにした。ゲノム関連解析により持続性EBV DNAの遺伝的決定因子を評価したところ、免疫関連調節領域における遺伝率の濃縮と、148遺伝子におけるタンパク質を変化させるバリアントが明らかになった。これらの座位の単一細胞解析およびパスウェイレベルの解析により、EBV DNA持続性の主な決定因子として、可変性の抗原プロセシングが示唆された。さらに、関連する遺伝子プログラムはB細胞と抗原提示細胞で濃縮されており、これは、これらの細胞のウイルスリザーバーおよびウイルス除去における役割と一致する。ヒト白血球抗原の遺伝型判定および予測されるウイルスエピトープ提示親和性は、主要組織適合遺伝子複合体クラスIIの多様性がEBV持続性の重要な調節因子であることを示唆している。総合的に我々の解析は、ヒトの集団規模のWGSデータの再解析によってウイルスDNA持続性の遺伝的構造を解明できることを示しており、この枠組みはより広範なヒトウイロームに一般化可能である。
