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免疫学：連続した組織軸にマッピングされた空間的なヒト胸腺細胞アトラス
Nature 635, 8039 doi: 10.1038/s41586-024-07944-6
T細胞は循環血中の前駆細胞から発生した後に胸腺へ入り、T細胞の成熟と選択を支える特殊なサブ区画を通って移動する。ヒトでは、この過程は胎児発生の初期に始まり、思春期の胸腺退縮まで非常に活発である。今回我々は、出生前および出生後初期の段階におけるこの過程の微小解剖学的基盤をマッピングするために、胸腺に関する定量的な形態学的枠組みである「皮質-髄質軸（Cortico-Medullary Axis）」を構築し、これを用いて空間分解解析を行った。我々は、キュレーションされたマルチモーダルな単一細胞アトラス、空間トランスクリプトーム、高分解能多重画像データに対してこの枠組みを適用することで、胸腺小葉のサイトカインネットワーク、胸腺細胞のカノニカルな軌跡、胸腺上皮細胞の分布が、胎児発生の第2三半期開始までに確立されていることを実証する。我々は、胸腺上皮細胞について、前駆細胞の組織ニッチや、ハッサル小体と関連する異なるサブタイプを突き止め、CD4 T細胞系譜とCD8 T細胞系譜の間で髄質へ入るタイミングが異なることを明らかにした。これらの知見は、Tリンパ球の発生を詳細に理解するための基礎となり、異なるプラットフォーム間での画像データ解析、アノテーション、OrganAxis構築（TissueTag）のための総合的なツールキットによって補完され、あらゆる組織に適応可能である。
