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古代DNA:氷期後のユーラシア西部の集団ゲノミクス

Nature 625, 7994 doi: 10.1038/s41586-023-06865-0

完新世のユーラシア西部では、人類の大規模な移動が複数回あった。今回我々は、これらの移動の大陸横断的な影響を調べるため、ユーラシア北部および西部の各地から収集した317人のゲノム(主に中石器時代および新石器時代のもの)に関して、ショットガン塩基配列解読を行った。そして、既報のデータと合わせてインピュテーションを行うことで、1600人を超える古代人の二倍体遺伝子型を得た。解析の結果、黒海からバルト海まで伸びるゲノム的な境界「大分断域(great divide)」の存在が明らかになった。中石器時代の狩猟採集民は、この地域を境に東西で遺伝学的に大きく分化しており、新石器化の影響も同様に東西で大きく異なっていた。この境界の西側では、農耕がもたらされた際に、多くの地域で狩猟採集民が農耕民にほぼ完全に取って代わられるなど、祖先系統の大規模な変化が生じた一方、東側では、同時代に祖先系統の顕著な変化は全く起こらなかった。同様に、西側では、新石器時代への移行後に遺伝的クラスター内の近縁度が低下したのに対し、ウラル山脈の東側では約4000年前まで近縁度は高いままであり、これは狩猟採集民の集団が局地的に存続していたことと一致する。この境界は、ヤームナヤ人に近縁の祖先系統が約5000年前にユーラシア西部一帯に広がった際に消滅し、その結果生じた第二の大きな入れ替わりは、1000年の間にヨーロッパの大半の地域に広がった。ヤームナヤ人の遺伝的起源と運命は長く不明であったが、我々は、ドン川中流域の狩猟採集民がこの系統祖先に寄与したことを明らかにする。その後、ヤームナヤ人集団は、球状アンフォラ文化に関連する人々と混合した後で、ヨーロッパへと広がった。類似の入れ替わりはシベリア西部でも起きており、我々は、シベリアの森林ステップからバイカル湖まで広がる「新石器ステップ」クラインから得た新たなゲノムデータを示す。先史時代のこれらの移動は、ユーラシア人集団の遺伝的多様性に重大な永続的影響を与えた。

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