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医学:コレラの第七次世界的流行には複数回の世界的伝播の波があったことを示す証拠

Nature 477, 7365 doi: 10.1038/nature10392

コレラ菌(Vibrio cholerae)は世界の多くの地域で地域的流行を起こしている重要な病原菌で、報告されるコレラの症例数は毎年300万〜500万例に上る。歴史的には、コレラの世界的流行と認められているものは7回ある。ジンバブエとハイチでの最近の大発生は、現在進行中の7回目の世界的流行に含まれる。血清型O1に属する菌(「古典型」と「エルトール型」という2つの生物型からなる)と、派生種であるO139型だけが伝染性コレラの原因となる。過去6回のコレラ世界的流行は古典型コレラ菌が原因だったと考えられているが、その後エルトール型が世界中に広がり、現在の世界的流行では古典型に取って代わっている。コレラの詳細な分子疫学的マッピングは、関係性の推定を可動性遺伝因子のようなサブゲノム領域によっていることが障害となっていて、第七次世界的流行に関係しているエルトール型単離菌株は多様性が見かけ上非常に高くなっている。現在の世界的流行を引き起こしている菌の基本的な系統関係を解明するため、世界各地域および流行の各時期を代表するコレラ菌単離株154の全ゲノム塩基配列で、高分解能マーカー(一塩基多型)を同定した。この系統関係を使って、第七次世界的流行は1950年代の共通祖先を持っており、少なくとも3回のそれぞれ独立しているが重複部分のある波としてベンガル湾から広がったこと、また数回の大陸間伝播があったことが示された。さらに、抗生物質耐性因子であるSXTファミリーの獲得が、世界的流行の拡大をどのような形にしたのかが明らかになり、またこの耐性因子ファミリーが初めて獲得されたのは、コレラ菌での耐性獲得の発見よりも少なくとも10年前だったこともわかった。

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