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細胞:Rho依存的転写終結のアロステリック機構

Nature 463, 7278 doi: 10.1038/nature08669

Rhoは、転写ユニット間の境界を決め、細菌の翻訳要求度に合わせて転写量を調節する、重要なRNAヘリカーゼである。Rhoは最初に見つかった転写終結因子であるが、それが伸長複合体(EC)に到達し、破壊する実際の機構はわかっていない。今回我々は、終結にかかわっているRho分子が、転写サイクルの間を通してRNAポリメラーゼ(RNAP)に結合していることを示す。つまり、新しい転写産物はRNAPとの最初の結合に必要でない。また、RNAP–Rho複合体形成は転写終結に不可欠である。RNAP依存的終結は、迅速なECの不活性化(捕捉)と比較的ゆっくりした解離からなる、2段階過程である。不活性化は、終結部位の位置を決める重要な律速段階である。捕捉機構は、進化的に保存された可動性のトリガー-ループ・ドメインによってアロステリックに誘導されるRNAP触媒中心の再構築に依存している。このドメインはECの解離にも必要である。我々が見いだしたRho依存的終結と内因性(Rho非依存的)終結経路の間の重要な構造的および機能的類似性は、終結のアロステリック機構が一般的で、進化の過程を通して細胞中のRNAPすべてに保存されてきた可能性が高いことを示している。

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