Article 生化学：タンパク質のDNA認識におけるDNA形状の役割 2009年10月29日 Nature 461, 7268 doi: 10.1038/nature08473 タンパク質による特定のDNA塩基配列の認識は、2種の機構に依存していると考えられている。その1つは、主に主溝で起こり、特定の塩基との水素結合の形成がかかわるもの、もう1つはDNAへリックスの配列に依存する変形がかかわるものである。本論文では、タンパク質–DNA複合体の三次元構造の網羅的解析により、狭い副溝へのアルギニン残基の結合が、タンパク質によるDNAの認識に広く用いられている方法であることを示す。この読み出し機構は、狭い副溝がDNAの負の静電ポテンシャルを大きく増強する現象を使っている。ヌクレオソーム・コア粒子は、この影響の顕著な例である。副溝が狭まることは、柔軟なTpAステップを含まないATに富んだ配列であるAトラクトの存在と関係している場合が多い。これらの知見は、DNAの形状や静電ポテンシャルの局所的な変化を検出できる能力は、タンパク質が副溝内にある情報を使えるようにするための一般的な機構であることを示している。これ以外では、副溝で塩基特異的な水素結合を形成してDNA結合の特異性を実現する機会はほとんどない。 Full Text PDF 目次へ戻る
