Letter 生理：HIV-1制限因子APOBEC3GのDNAデアミナーゼドメインの構造 2008年3月6日 Nature 452, 7183 doi: 10.1038/nature06638 ヒトAPOBEC3G（apolipoprotein B messenger-RNA-editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3G）タンパク質は、ヒト免疫不全ウイルス1（HIV-1）やその他のレトロウィルス、およびレトロトランスポゾンの複製を阻害する一本鎖DNAデアミナーゼである。APOBEC3Gの抗ウイルス活性は、HIV-1 Vifによる完全な分解などのように、大部分のレトロエレメントによって回避される。APOBEC3Gはポリヌクレオチドシトシンデアミナーゼ・ファミリーに属するが、このファミリーには別の生理学的基質を標的とするものもある。例えば、APOBEC1はAPOBmRNAを編集し、AIDは抗体遺伝子のDNAを脱アミノ化する。このファミリーの他のメンバーの構造は得られているが、ポリヌクレオチドシトシンデアミナーゼ活性や抗ウイルス活性を示すものはない。今回我々は、ヒトAPOBEC3G触媒ドメインの溶液構造を報告する。5本のαへリックス（うち2本は亜鉛に配位して活性部位を形成している）は、5本のβストランドからなる疎水性プラットフォーム上に配置されている。NMR DNA滴定実験、コンピューターモデリング、構造の系統間での保存性、および大腸菌を用いた活性測定を組み合わせると、正電荷をもつ残基からなる縁部分が触媒作用の標的であるシトシンの位置を定めるというDNA結合モデルが考えられる。APOBEC3G触媒ドメインの構造は、このファミリーの他のメンバーの機能解明や、HIV-1 Vifのような病原性タンパク質との相互作用の解明に役立つだろう。 Full Text PDF 目次へ戻る
