Letter

海洋:海洋沿岸域でのゼネラリスト細菌種による炭素処理

Nature 451, 7179 doi: 10.1038/nature06513

海洋性細菌プランクトンによる溶存有機炭素(DOC)の同化と無機化は、海洋の炭素サイクルにおける主要な過程である。しかしながら、関与している細菌の特定の代謝機能について、また、個々の分類群が海洋のDOCプールの特定の要素に関して特殊化しているかどうかについては、ほとんど知見がない。本論文では、実験的メタゲノミクスを用いて、沿岸の細菌群集が、広範囲にわたる有機炭素化合物を代謝する能力をもつ分類群によって構成されていることを示す。DOCプールの単一モデル成分(ジメチルスルホニオプロピオン酸またはバニリン酸)を代謝する細菌群集のサブセットから得られたゲノムDNAから、遺伝子構成と選択された表現型以外の多様な炭素処理能力がともに、相当度重複していることが示された。細菌の機能群のニッチの範囲について直接測定した結果は、生態学理論と一致しており、有機炭素の組成と沿岸への供給の不均一性がゼネラリスト細菌に有利に働いている可能性を示している。微生物群集構造と生物地球化学的循環との間での重要な相互作用では、沿岸の従属栄養群集は、それらが処理する炭素貯蔵庫の一時的変化によるよりも、栄養的相互作用と物理的諸条件のような要因によって強く制御されていると考えられる。

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