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生化学:PAZドメインによる突出部分特異的な低分子干渉RNA認識についての構造的基盤

Nature 429, 6989 doi: 10.1038/nature02519

低分子RNAは、真核生物におけるウイルス耐性や発生制御、ヘテロクロマチン形成に関連するプロセスである遺伝子サイレンシングを仲介する。RNAサイレンシングは、Dicerを介した二本鎖RNAの低分子干渉RNA(siRNA)への分解によって始まる。siRNAガイド鎖はサイレンシングエフェクター複合体中のArgonauteタンパク質と結合し、相補的配列を認識してそれらをサイレンシングの標的とする。PAZドメインは、Argonauteおよび一部のDicerタンパク質中に見いだされたRNA結合モジュールで、その構造はRNAに結合していない状態で決定されている。本研究で我々は、9塩基のsiRNA様二本鎖の両末端と結合したヒト由来Argonaute eIF2clのPAZドメインの結晶構造を分解能2.6Åで報告する。配列非依存的に、PAZはsiRNA様二本鎖の2塩基の3′突出末端を高度に保存された結合ポケット内につなぎとめており、突出末端を含む鎖の7塩基のホスホジエステル主鎖と結合し、かつ相補鎖の5′末端残基をキャッピングすることにより、二本鎖を固定している。構造と結合アッセイにもとづき、我々は、PAZがRNAサイレンシング過程におけるsiRNA運搬のためのsiRNA末端結合モジュールとして働き、そしてサイレンシングエフェクター複合体内においてガイドRNAの3′末端をつなぎとめる部位として働いている可能性を示唆する。

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