Letter 遺伝：黒色腫ゲノムの塩基配列解読によって明らかになった頻発性のPREX2変異 2012年5月24日 Nature 485, 7399 doi: 10.1038/nature11071 黒色腫は、転移傾向、進行黒色腫での致死性、および若年期における紫外線暴露との関連がよく知られている。ヒト黒色腫ゲノムの全体像を得るために、25例の転移性黒色腫ゲノムとそれにマッチした生殖細胞系列のDNA塩基配列を解読した。点変異率は大幅に変動しており、最も変異率が低かったのは紫外線暴露を受けていない手足の無毛皮膚に原発巣が生じた黒色腫［ゲノムのメガベース（Mb）当たり3〜14個］で、中間の変異率は体幹の有毛部皮膚に原発巣が生じた黒色腫（Mb当たり5〜55個）、そして変異率が最も高かったのは慢性的な日光暴露がわかっている患者の黒色腫（Mb当たり111個）だった。全ゲノム塩基配列データの解析から、乳がんにおいてPTENと相互作用するタンパク質で、PTENの負の調節因子であるPREX2（phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchange factor 2）が、有意な変異遺伝子であることが明らかになり、107例のヒト黒色腫からなる独立した拡大コホートでの変異頻度は約14%であった。変異型PREX2を異所性に発現させると、in vivoでヒト不死化メラニン形成細胞の腫瘍形成が促進されることから、PREX2変異に生物学的役割があることがわかる。したがって、ヒト黒色腫の全ゲノム塩基配列解読により、紫外線による発がん作用のゲノムに基づく証拠が得られ、また、黒色腫に頻発する新しい変異遺伝子が発見された。 Full Text PDF 目次へ戻る
