Research Abstract

日本人165,436人を対象とした喫煙行動のGWASから7つの新たな遺伝子座と共通の遺伝的構造が明らかとなった

GWAS of smoking behaviour in 165,436 Japanese people reveals seven new loci and shared genetic architecture

2019年3月25日 Nature Human Behaviour 3 : 3 doi: 10.1038/s41562-019-0557-y

日本人165,436人を対象とした喫煙行動のGWASから7つの新たな遺伝子座と共通の遺伝的構造が明らかとなった
拡大する

喫煙は、ヒトのさまざまな疾患のリスク因子である。日本人集団における喫煙行動に関連する遺伝的因子を調べるために、165,436人を対象として、喫煙に関連した4つの形質について全ゲノム関連解析を行った。その結果、1日あたりの喫煙本数に関連する3つの遺伝子座(EPHX2–CLURETCUX2–ALDH2)、喫煙の開始に関連する3つの遺伝子座(DLC1CXCL12–TMEM72-AS1GALR1–SALL3)、喫煙開始年齢に関連する1つの遺伝子座(LINC01793–MIR4432HG)を含む計7つの新たな遺伝子座が同定された。このうち3つの遺伝子座(LINC01793–MIR4432HGCXCL12–TMEM72-AS1GALR1–SALL3)は、追加の性別層別化全ゲノム関連解析によって明らかとなったものである。この追加の解析からは、男女で影響に差があることが判明した。異性間連鎖不均衡スコア回帰分析の結果からも、喫煙開始の遺伝的因子に男女間で有意差があることがわかった。形質間連鎖不均衡スコア回帰分析および形質関連組織解析から、1日あたりの喫煙本数には、他の3つの喫煙行動とは異なる特異的な遺伝的背景があることが明らかとなった。また、喫煙行動と遺伝的背景が共通する11の疾患についても報告する。今回の研究は追試試料を欠くため慎重に考慮すべきであるが、得られた知見は、喫煙行動の遺伝的構造を明らかにするものである。東アジア人集団を対象としたさらなる研究によって、我々の結果が確認されることが必要である。 日本人集団の喫煙行動の遺伝的因子が調べられ、喫煙行動に関連する7つの遺伝子座と、喫煙行動と遺伝的背景を共有する11の疾患が同定された。

Nana Matoba, Masato Akiyama, Kazuyoshi Ishigaki, Masahiro Kanai, Atsushi Takahashi, Yukihide Momozawa, Shiro Ikegawa, Masashi Ikeda, Nakao Iwata, Makoto Hirata, Koichi Matsuda, Michiaki Kubo, Yukinori Okada and Yoichiro Kamatani

Corresponding Author

鎌谷 洋一郎
理化学研究所 生命医科学研究センター 統計解析研究チーム、京都大学大学院

Cigarette smoking is a risk factor for a wide range of human diseases1. To investigate the genetic components associated with smoking behaviours in the Japanese population, we conducted a genome-wide association study of four smoking-related traits using up to 165,436 individuals. In total, we identified seven new loci, including three loci associated with the number of cigarettes per day (EPHX2–CLU, RET and CUX2–ALDH2), three loci associated with smoking initiation (DLC1, CXCL12–TMEM72-AS1 and GALR1–SALL3) and LINC01793–MIR4432HG, associated with the age of smoking initiation. Of these, three loci (LINC01793–MIR4432HG, CXCL12–TMEM72-AS1 and GALR1–SALL3) were found by conducting an additional sex-stratified genome-wide association study. This additional analysis showed heterogeneity of effects between sexes. The cross-sex linkage disequilibrium score regression2,3 analysis also indicated that the genetic component of smoking initiation was significantly different between the sexes. Cross-trait linkage disequilibrium score regression analysis and trait-relevant tissue analysis showed that the number of cigarettes per day has a specific genetic background distinct from those of the other three smoking behaviours. We also report 11 diseases that share genetic basis with smoking behaviours. Although the current study should be carefully considered owing to the lack of replication samples, our findings characterized the genetic architecture of smoking behaviours. Further studies in East Asian populations are warranted to confirm our findings.

「おすすめのコンテンツ」記事一覧へ戻る

プライバシーマーク制度