Research press release


Nature Communications

Cancer: Identifying the best ovarian cancer models


臨床腫瘍検体に由来するがん細胞株は、がん研究に頻繁に利用され、がんの生物学的性質に数多くの手がかりをもたらしてきた。今回、Nikolaus Schultzの研究チームは、「がんゲノムアトラス」(臨床卵巣がん検体のゲノムの特徴を明らかにした)と「がん細胞株百科事典」(研究に用いられる約1,000種のがん細胞株のゲノムの特徴に関するデータが含まれる)という大規模な遺伝子配列解読プロジェクトの一般公開されたデータセットの解析を行った。Schultzたちは、この2種類のデータを相互に照合し、約50種の卵巣がん細胞株について、高悪性度漿液性卵巣がん(HGSOC)患者から採取した臨床検体とのゲノムの類似性に基づくランキングを作成した。その結果、HGSOCに関する既発表論文の60%を占め、最も頻繁に用いられている卵巣がん細胞株2種が、HGSOCとの類似性がそれほど高くないことが判明した。その一方で、最適な卵巣がん細胞株12種は、既発表論文のわずか1%でしか使われていなかった。


Some of the most popular ovarian cancer cell lines used for research may not be good models of ovarian cancer, a genomic analysis published in Nature Communications reveals.

Cancer cell lines derived from clinical tumour samples are frequently used in cancer research and have led to many new insights into cancer biology. Nikolaus Schultz and his team analysed publicly available datasets from two large-scale genetic sequencing projects - the Cancer Genome Atlas, which defined the genomic features of clinical ovarian cancer samples, and the Cancer Cell Line Encyclopedia, which contains similar data for about 1,000 cancer cell lines used for research. Schultz’ team matched these data against each other, ranking about 50 ovarian cancer cell lines by their genomic similarity with clinical samples from patients with high-grade serous ovarian cancer (HGSOC). They find that the two most popular ovarian cancer cell lines, accounting for 60% of all published research articles on HGSOC, do not resemble HGSOC very well, while the 12 most suitable ovarian cancer cell lines were used in only 1% of publications.

The study provides a methodological framework that could also be applied to other cell lines and different types of cancers in order to assess their validity as research tools.

doi: 10.1038/ncomms3126

「Nature 関連誌注目のハイライト」は、ネイチャー広報部門が報道関係者向けに作成したリリースを翻訳したものです。より正確かつ詳細な情報が必要な場合には、必ず原著論文をご覧ください。

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