Research press release


Nature Communications

Biotechnology: ‘Porcupine’ system tags objects with DNA

DNA塩基配列で対象物を「標識」するシステムについて報告する論文が、Nature Communications に掲載される。「Porcupine(ヤマアラシ)」と命名されたこのシステムは、ヤマアラシの針状の毛が物にくっつくことから着想したもので、対象物の追跡に用いることができ、RFIDタグやQRコードが適さないような非常に小さな物体の追跡にも使用できる。この標識は、携帯デバイスを使用して数秒以内に解読できる。

今回、Katie Doroschakたちの研究チームは、DNA塩基配列をIDとして用いる分子標識システムPorcupineを設計した。このDNA標識は、あらかじめ定義された塩基配列(著者たちがmolbitsと命名)からなり、これを組み合わせて一意的な「バーコード」を作ることができる。それぞれのDNA塩基配列は、携帯型ナノポアDNAシーケンサーを使って直接解読できるよう設計されており、低リソース環境でもオンデマンドで読み出すことができる。Porcupineは、基本的な実験装置を用いて大量の一意的なタグ(約42億個)を生成できるように設計されている。Doroschakたちが行った原理実証実験では、このシステムを用いて、Molecular Information Systems Labの頭字語MISLを数秒以内に確実に符号化・復号化できた。


A system that uses DNA sequences to ‘tag’ objects, is reported today in Nature Communications. Inspired by how its namesake’s quills stick to things, ‘Porcupine’ could be used for tracking, even on the smallest of objects when RFID tags or QR codes are not suitable. The tags can also be decoded within seconds using a portable device.

Katie Doroschak and colleagues design Porcupine as a molecular tagging system, using a DNA sequence as identification. The DNA tags are made from predefined sequences the authors call ‘molbits’, which can be combined to create unique ‘barcodes’. Each DNA sequence is designed to be read directly from a portable nanopore DNA sequencer to enable on-demand readout in low resource environments. Porcupine is designed to generate a large number of unique tags (approximately 4.2 billion) using basic laboratory equipment. In a proof of principle experiment, the authors were able to reliably encode and then decode within a few seconds the acronym MISL (Molecular Information Systems Lab) using their system.

The authors envision their work being used in situations where existing tagging methods such as RFID tags or QR codes cannot be applied, such as tagging very small items or large quantities of objects, or both. Other uses could include anti-forgery, which requires the tag to be invisible.

doi: 10.1038/s41467-020-19151-8

「Nature 関連誌注目のハイライト」は、ネイチャー広報部門が報道関係者向けに作成したリリースを翻訳したものです。より正確かつ詳細な情報が必要な場合には、必ず原著論文をご覧ください。

メールマガジンリストの「Nature 関連誌今週のハイライト」にチェックをいれていただきますと、毎週最新のNature 関連誌のハイライトを皆様にお届けいたします。