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ゲノムアノテーション:ヒト遺伝学を読み解くための塩基配列に基づく調節活性の大域的マップ
A sequence-based global map of regulatory activity for deciphering human genetic p.940
doi: 10.1038/s41588-022-01102-2
腎疾患:エピゲノムおよびトランスクリプトームの解析から、腎疾患の中心的な細胞タイプ、遺伝子、標的可能な機構が明らかになる
Epigenomic and transcriptomic analyses define core cell types, genes and targetable mechanisms for kidney disease p.950
doi: 10.1038/s41588-022-01097-w
大腸がん:一細胞およびバルクのトランスクリプトーム塩基配列解読によって上皮腫瘍細胞の2つの状態が明らかになり、大腸がんのコンセンサス分子分類を改良
Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies two epithelial tumor cell states and refines the consensus molecular classification of colorectal cancer p.963
doi: 10.1038/s41588-022-01100-4
大腸がん:彷徨試験を改変した手法により大腸がんの持続生残細胞の集団動態と変異率の特徴が明らかになる
A modified fluctuation-test framework characterizes the population dynamics and mutation rate of colorectal cancer persister cells p.976
doi: 10.1038/s41588-022-01105-z
大腸がん:一細胞解析により、ポリープから大腸がんへの悪性形質転換における連続的な細胞状態変化や組成変化が明らかになる
Single-cell analyses define a continuum of cell state and composition changes in the malignant transformation of polyps to colorectal cancer p.985
doi: 10.1038/s41588-022-01088-x
免疫療法:チェックポイント阻害依存性の抗腫瘍免疫におけるPOLEおよびPOLD1変異が機能に及ぼす影響の全体像
Functional landscapes of POLE and POLD1 mutations in checkpoint blockade-dependent antitumor immunity p.996
doi: 10.1038/s41588-022-01108-w
3Dゲノミクス:DeepLoopはキロ塩基対解像度の疎な対立遺伝子別Hi-Cデータや一細胞Hi-Cデータを用いて、クロマチン相互作用をロバストにマッピングする
DeepLoop robustly maps chromatin interactions from sparse allele-resolved or single-cell Hi-C data at kilobase resolution p.1013
doi: 10.1038/s41588-022-01116-w
3Dゲノミクス:CTCFが集まったドメイン境界のin vivo解析から明らかになった調節性インスレーターの形成原理
In vivo dissection of a clustered-CTCF domain boundary reveals developmental principles of regulatory insulation p.1026
doi: 10.1038/s41588-022-01117-9
発生:シス調節配列の機能的層別化と発生動態を伴う、ゼブラフィッシュマルチオミクスアトラス
Multiomic atlas with functional stratification and developmental dynamics of zebrafish cis-regulatory elements p.1037
doi: 10.1038/s41588-022-01089-w
発生:マウス発生の一細胞アトラスを用いた細胞運命調節プログラムの系統的な同定
Systematic identification of cell-fate regulatory programs using a single-cell atlas of mouse development p.1051
doi: 10.1038/s41588-022-01118-8