今月号

Volume 52 Number 3

がん種横断的全ゲノム解析(PCAWG)

クジャクの羽根の目玉模様にはめこまれたcircosプロットは、がん全ゲノムの再編成を表している。ゲノム損傷タイプと染色体異常の程度が、国際がんゲノムコンソーシアム(ICGC)とがんゲノムアトラス(TCGA)によって創設された、がん種横断的全ゲノム解析(PCAWG)コンソーシアムによって調べられ、整理された。これらの腫瘍検体の塩基配列決定データは、がんゲノム研究コミュニティーにおいて、豊かな資源として活用されることになるだろう。

参照論文:Akdemir et al. Article p.294, Rodriguez-Martin et al. Article P.306, Zapatka et al.
Article p.320, Cortés-Ciriano et al. Analysis p.331, and Yuan et al. Analysis p.342
画像制作:Pink Cactus / iStock / Getty Images Plus

表紙デザイン:Erin Dewalt

目次

注目のハイライト

その他のハイライト

Editorial

News & Views

機能ゲノミクス:サイレンサーに注目する

Silencers in the spotlight p.244

doi: 10.1038/s41588-020-0583-8

Letter

自己免疫疾患:対立遺伝子特異的発現はT細胞活性化の間にHLAや他の自己免疫座位で動的に変化する

Allele-specific expression changes dynamically during T cell activation in HLA and other autoimmune loci p.247

doi: 10.1038/s41588-020-0579-4

Articles

サイレンサー:ヒト細胞におけるサイレンサーの体系的同定

Systematic identification of silencers in human cells p.254

doi: 10.1038/s41588-020-0578-5

サイレンサー:クロマチン相互作用解析で明らかになった、マウス発生におけるPRC2結合サイレンサーの役割

Chromatin interaction analyses elucidate the roles of PRC2-bound silencers in mouse development p.264

doi: 10.1038/s41588-020-0581-x

エピジェネティクス:ヒストンH3.3のリシン4は胚性幹細胞の分化、調節領域でのヒストン密度および転写の正確性に必要である

Lysine 4 of histone H3.3 is required for embryonic stem cell differentiation, histone enrichment at regulatory regions and transcription accuracy p.273

doi: 10.1038/s41588-020-0586-5

全ゲノム重複:がんの進化における全ゲノム重複と有害変化蓄積との相互作用

Interplay between whole-genome doubling and the accumulation of deleterious alterations in cancer evolution p.283

doi: 10.1038/s41588-020-0584-7

がん種横断的全ゲノム解析:ヒトがんではクロマチンを折りたたむドメインの破壊が体細胞ゲノム再編成により起こる

Disruption of chromatin folding domains by somatic genomic rearrangements in human cancer p.294

doi: 10.1038/s41588-019-0564-y

がん種横断的全ゲノム解析:がん種横断的な全ゲノム解析からLINE-1のレトロトランスポジションによって促進されたドライバー再編成が明らかになる

Pan-cancer analysis of whole genomes identifies driver rearrangements promoted by LINE-1 retrotransposition p.306

doi: 10.1038/s41588-019-0562-0

がん種横断的全ゲノム解析:ヒトがんのウイルスとの関連性の全体像

The landscape of viral associations in human cancers p.320

doi: 10.1038/s41588-019-0558-9

Analysis

がん種横断的全ゲノム解析:全ゲノム塩基配列決定を用いた2,658のヒトがんにおけるクロモスリプシスの包括的解析

Comprehensive analysis of chromothripsis in 2,658 human cancers using whole-genome sequencing p.331

doi: 10.1038/s41588-019-0576-7

がんゲノム:ヒトのがんにおけるミトコンドリアゲノムの包括的な分子特性解析

Comprehensive molecular characterization of mitochondrial genomes in human cancers p.342

doi: 10.1038/s41588-019-0557-x

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