遺伝学：大麻使用障害の遺伝学的解析
Genetics: Genetics of cannabis use disorder
doi: 10.1038/s41588-023-01563-z
Volume 52 Number 11
TADの内部が超高分解能の顕微鏡で明らかになった
ゲノムは3次元に組織化され、トポロジカルドメイン（TAD）に折りたたまれる。しかし、一細胞レベルでのTADの特徴や折りたたみについては、明らかになっていない。今回、超高分解能の光学顕微鏡を使うことで、Hi-C法で同定された個々のTADから平均的なTAD（ここではプリズムの内部として表されている）が導き出された。個々のTADは、さまざまな形状の不均一な構造で、バリエーションに富んでおり、不均一なクロマチンナノドメイン（ここでは回析した光線から現れてくる構造として表されている）に分割される。また、定量的な顕微鏡解析により、TADやクロマチンナノドメイン構造の制御におけるCTCF、コヒーシン、ヌクレオソーム相互作用の役割が分かり、一細胞ゲノム組織化を明らかにする上での画像解析の威力が明らかになってきた。
参照論文：Szabo et al. Letter p.1151
画像制作：Adrien Méchali, Quentin Szabo, Frédéric Bantignies and Giacomo Cavalli
表紙デザイン：Erin Dewalt
目次
注目のハイライト
遺伝学：免疫応答に関連する遺伝子がダウン症候群の特徴に影響を与えている
Genetics: Immune responses may influence Down syndrome
doi: 10.1038/s41588-023-01399-7
News & Views
がんの進化：進化的依存度はがん発生の道筋を示す
Evolutionary dependencies show paths to cancer development p.1135
doi: 10.1038/s41588-020-00728-4
発がん：発がん物質は直接的な変異原か？
Are carcinogens direct mutagens? p.1137
doi: 10.1038/s41588-020-00730-w
Perspective
がん：発がんリスクにおける体細胞変異および環境中の腫瘍促進因子の重要性
The critical roles of somatic mutations and environmental tumor-promoting agents in cancer risk p.1139
doi: 10.1038/s41588-020-00727-5
Letters
劣性遺伝性疾患：劣性遺伝性繊毛病における副次的なバリアントの遺伝的な役割と生物学的モジュール全体にわたる非ランダムな分布の証拠
Evidence for secondary-variant genetic burden and non-random distribution across biological modules in a recessive ciliopathy p.1145
doi: 10.1038/s41588-020-0707-1
次元ゲノム：一細胞でのTADおよびクロマチンナノドメインへのゲノム組織化の調節
Regulation of single-cell genome organization into TADs and chromatin nanodomains p.1151
doi: 10.1038/s41588-020-00716-8
Articles
神経変性疾患：一細胞エピゲノム解析から示された、アルツハイマー病とパーキンソン病に対する遺伝的リスク座位の原因バリアント候補
Single-cell epigenomic analyses implicate candidate causal variants at inherited risk loci for Alzheimer’s and Parkinson’s diseases p.1158
doi: 10.1038/s41588-020-00721-x
冠動脈疾患：民族特異的ならびに民族横断的なゲノムワイド解析により、冠動脈疾患の民族特異的ならびに民族間で共通のリスク座位を同定する
Population-specific and trans-ancestry genome-wide analyses identify distinct and shared genetic risk loci for coronary artery disease p.1169
doi: 10.1038/s41588-020-0705-3
がんゲノム：がんゲノム中の体細胞変異の分布は3次元クロマチン構造によって変化する
Somatic mutation distributions in cancer genomes vary with three-dimensional chromatin structure p.1178
doi: 10.1038/s41588-020-0708-0
がんゲノム：ヒトで既知の発がん物質と発がん性が疑われる物質のマウスにおける変異シグネチャープロファイル
The mutational signature profile of known and suspected human carcinogens in mice p.1189
doi: 10.1038/s41588-020-0692-4
がんゲノム：ヒトがんにおける機能的な進化的依存度の発見
Discovering functional evolutionary dependencies in human cancers p.1198
doi: 10.1038/s41588-020-0703-5
がんゲノム：全がん一細胞RNA-seqから、頻発する細胞不均一性プログラムを特定
Pan-cancer single-cell RNA-seq identifies recurring programs of cellular heterogeneity p.1208
doi: 10.1038/s41588-020-00726-6
がんゲノム：がん治療によりクローン性造血の適応度の全体像が形作られる
Cancer therapy shapes the fitness landscape of clonal hematopoiesis p.1219
doi: 10.1038/s41588-020-00710-0
エンハンサー：高度に相互接続されたエンハンサー共同体がヒト間葉系幹細胞において細胞系譜決定遺伝子を制御する
Highly interconnected enhancer communities control lineage-determining genes in human mesenchymal stem cells p.1227
doi: 10.1038/s41588-020-0709-z
Technical Reports
オミックス解析：関節組織のトランスクリプトームワイド関連解析とメンデル無作為
A unified framework for joint-tissue transcriptome-wide association and Mendelian randomization analysis p.1239
doi: 10.1038/s41588-020-0706-2
3次元ゲノム：CHESSはクロマチン接触データの定量的比較と自動特性抽出を可能にする
CHESS enables quantitative comparison of chromatin contact data and automatic feature extraction p.1247
doi: 10.1038/s41588-020-00712-y
植物ゲノム：非近交系マッピング集団を用いた倍数性植物ゲノムのための全染色体
Assembly of whole-chromosome pseudomolecules for polyploid plant genomes using outbred mapping populations p.1256
doi: 10.1038/s41588-020-00717-7
