Letter 生物学的ネットワーク力学のコンピュータシミュレーション 2004年8月1日 Nature Biotechnology 22, 8 doi: 10.1038/nbt991 ひとつの細胞がもつ分子の数は少ないため、生物学的ネットワークの現実的なシミュレーションには確率的シミュレーション方法が必要である。従来のマイクロプロセッサを用いたコンピュータ上での確率的シミュレーションの計算に高いコストがかかるのは、マイクロプロセッサのプログラムが実行する連続ステップと、生物化学的ネットワークがもつ並列度の高い情報の流れとが本質的に異なるためである。この差は本論文で紹介するフィールド・プログラマブル・ゲート・アレイ（FPGA）を用いた方法によって埋められる。生物学的ネットワークの基本的な反応段階をシミュレーションすることができるFPGAの並列アーキテクチャでは、現在利用されているマイクロプロセッサとの比較でシミュレーション速度が少なくとも一桁高くなる。 Full text PDF 目次へ戻る
