微生物学：未知の細菌を知る

全細菌の15％以上は、細菌系統樹のうち、ほとんど未知で培養例が皆無の複数の門からなる1つの放散を構成している。今回J Banfieldたちは、メタゲノミクスを利用して、米国コロラド川に隣接する帯水層に由来する地下水試料から得られた、この放散に属する35を超える門の細菌について、8例の完全ゲノムおよび789例の概要ゲノムを再構築した。そのデータから共通の進化史が明らかになったため、著者たちはこれらの門を細菌ドメイン内の下位区分として、「Candidate Phyla Radiation（CPR）」という名称でくくった。CPR細菌の特徴は、生合成経路の多くを欠く小型のゲノム、リボソームRNA遺伝子内にコードされた自己スプライシングするイントロンおよびタンパク質、全ての細菌に普遍的と考えられていたタンパク質が存在しない独特のリボソーム構成などである。CPR細菌は、生存を他の生物に依存する絶対的発酵菌であるらしい。

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