Brief Communication

多モードの単一細胞・空間オミクス用の現実的なin silicoデータを生成するscDesign3

Nature Biotechnology 42, 2 doi: 10.1038/s41587-023-01772-1

本論文では、実際のデータから解釈可能なパラメーターを学習することにより、さまざまな細胞状態、実験計画、特徴のモダリティーをなどの現実的な単一細胞・空間オミクスデータを生成する統計的シミュレーターであるscDesign3を紹介する。scDesign3は、単一細胞・空間オミクスデータ用の統一的な確率モデルを用いて、生物学的に意味のあるパラメーターを推測し、推測された細胞のクラスター、経路、空間的位置の適合度を評価し、計算ツールのベンチマーキングに用いるin silicoの正負の対照を生成する。

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