Research press release





今回、Nils Steinたちの研究グループは、ショットガン法による塩基配列決定と染色体規模でスキャフォールド配列を得る新しい方法などを組み合わせて用いることで、質の高い基準ゲノムを作成した。これは、コムギ、ライムギなどが含まれる植物分類群であるコムギ連(Triticeae)の穀物にとって初めての質の高い基準ゲノムだ。Steinたちは、この基準ゲノムを品種改良に活用する可能性を模索しようと、ヨーロッパのオオムギの優良系統(96系統)のコード領域の塩基配列を決定し、比較して、遺伝的多様性の特徴を明らかにし、強い選択の特徴を示す領域を同定した。強い選択は、例えば麦芽用オオムギと飼料用オオムギを生産するためのさまざまな性質を作り出すための品種改良があったことを反映している可能性がある。

The sequence of the barley genome is reported in this week’s Nature. A notable and long-awaited community resource for cereal genetics and genomics, the genome will provide vital information for researchers who seek to improve and modify barley through breeding.

One of the first grains to be cultivated, today barley is a major cereal crop, widely grown in temperate regions. However, 80% of the barley genome consists of repetitive sequences and other features that make it hard to sequence.

Nils Stein and colleagues used a combined approach, including shotgun sequencing and a new method using chromosome-scale scaffolding, to produce a high-quality reference genome. This represents the first high-quality reference genome for a member of the Triticeae tribe - the group of plants that includes wheat and rye. To explore how the genome could be exploited for breeding, the authors sequenced and compared gene-coding regions of 96 European elite barley lines, characterized genetic diversity and identified regions showing signatures of intense selection, which may reflect breeding to produce different characteristics, such as for the production of malting versus feed barley.

doi: 10.1038/nature22043

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