細胞生物学：染色体歩行を用いた染色体トポロジーの決定

染色体は、コンパクトな構造を保ちながら、DNAへのアクセスも調節するために、核内では効率よく折りたたまれていなくてはならない。3C（chromosome conformation capture）法は染色体構造を調べるために用いる解析方法の1つで、ゲノム座位間の空間的に近接した2か所をペアとして検出できる。今回A Tanayたちは、染色体歩行（C-walk）を用いる3C塩基配列解読法を開発し、多数のゲノム座位をまとめて、空間的に近傍にある鎖に関連付けた。著者たちは、哺乳類細胞にこの技術を適用して、染色体テリトリーやトポロジカルドメイン（TAD；topologically associated domain）が、入れ子になった階層的な折りたたみ構造の一部であることを示し、また活性な遺伝子と不活性な遺伝子の周囲の染色体コンホメーションの特徴を明らかにした。これらの知見は、染色体の高次構造がゲノム調節に関与する仕組みについての我々の理解を深めるのに役立つ。

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