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遺伝学：ダウン症候群のゲノム全体に見られる遺伝子発現調節異常ドメイン
Nature 508, 7496 doi: 10.1038/nature13200
21トリソミーは、認知機能障害の最もよく見られる遺伝学的原因である。我々は、21トリソミーにおける遺伝子発現の乱れを評価し、またゲノム変動性というノイズを除去するために、21トリソミーに関して不一致な一卵性双生児1組に由来する胎児繊維芽細胞のトランスクリプトームを調べた。本論文では、この双生児間で違いのある遺伝子発現は、全ての染色体にわたって、上向き調節もしくは下向き調節されるドメインの形をなしていることを示す。これらの遺伝子発現調節異常ドメイン（gene expression dysregulation domain；GEDD）は、そこに含まれる遺伝子の発現レベルによって特徴付けられ、また、この双生児の繊維芽細胞に由来する誘導多能性幹細胞でよく保存されている。ダウン症候群のTs65Dnマウスモデルと正常な同腹仔マウスの繊維芽細胞のトランスクリプトームの比較から、ヒトとシンテニーのあるマウス染色体に沿ったGEDDも明らかになった。これらのGEDDは、哺乳類細胞のラミナ関連ドメイン（LAD）および複製ドメインと相関している。LADの全体的な配置はトリソミー細胞で変化していなかったが、トリソミー繊維芽細胞のH3K4me3プロファイルは変更されており、GEDDのパターンに正確に従っていた。これらの結果は、トリソミー細胞の核区画が、トランスクリプトームの全体に影響を及ぼすようなクロマチン環境の変化を被ること、従ってGEDDが21トリソミーの表現型の一部に関与している可能性を示している。
