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生化学:タンパク質の構造および動態の同時決定

Nature 433, 7022 doi: 10.1038/nature03199

本論文では、ネイティブ構造とそれに関連する動態を同時に示すタンパク質コンホメーション集合体の実験的決定のプロトコールを報告する。この方法は、タンパク質の構造的特徴および動力学的特徴に関する原子レベルでの実験的情報を得るための核磁気共鳴分析法の長所と、広範囲のタンパク質構造を探索することのできる分子動態シミュレーションとを組み合わせたものである。我々は溶液中のヒト・ユビキチンでこの方法を用い、タンパク質構造の全範囲にわたってコンホメーションにかなりの不均一性があることを見出した。タンパク質内部の原子は集合体を形成している個別のコンホメーション内に緊密に詰め込まれているが、それら全体としての挙動はかなり液状に近い性質を持つと考えられる。このプロトコールはまったく一般的なものであり、ネイティブなタンパク質構造を理解し、利用する上で著しい進歩をもたらすであろう。

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