Research press release


Nature Genetics

The genome of the common carp

コイ(Cyprinus carpio)のゲノム塩基配列が解読された。野生系統と養殖系統の相違点の遺伝的基盤を明らかにするうえで重要な成果である。


今回、X Sunたちは、4集団の野生系統と6つの養殖系統に由来する合計33匹のコイのゲノムの配列解読を行った。そのうち、2つの一般的な養殖系統(HebaoとSongpu)の間では、894個の遺伝子で発現レベルに差が見られた。それらの遺伝子の多くは、うろこの発生と色素沈着に関係している。例えば、slc7a11遺伝子は、茶色の色素を黄色や赤色の色素に転換する役割を持っている。今回解読されたゲノム配列は、経済的に重要な形質に関する情報をもたらしており、養殖者が養殖コイの遺伝的改良を行ううえでも役に立つだろう。

The genome sequence of the common carp, Cyprinus carpio, is reported in a paper published online this week in Nature Genetics. The results can help to uncover the genetic basis of differences in wild and farmed carp varieties.

Carp is the top species of farmed fish; the common carp is responsible for up to 10% of worldwide freshwater aquaculture production, or more than three million metric tons of fish, per year. In addition, some varieties, such as koi, are also used for decorative purposes in outdoor landscaping and tanks. Carp varieties differ widely in traits such as skin color, scale pattern and body size.

Xiaowen Sun and colleagues sequenced the genomes of 33 fish from four wild populations and six domestic strains. Between two common varieties, Hebao and Songpu, they found 894 genes that are expressed at different levels. Many of these genes are involved in scale development and pigmentation. For example, the gene slc7a11 converts brown pigment to yellow and red. The genome sequence may also provide information on economically important traits and help breeders to make genetic improvements to farmed carp.

doi: 10.1038/ng.3098


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