Research press release


Nature Genetics

Sequencing of small-cell lung cancer exomes

2つの独立した研究で、小細胞肺がん患者から採取した検体(82点)を用いて、小細胞肺がんのエキソームの塩基配列の解読と解析が行われ、いくつかの治療介入の標的候補が同定された。それぞれの研究結果を報告する論文が、今週、Nature Genetics(オンライン版)に掲載される。


今回、R Thomasたちは、小細胞肺がんのエキソーム(29例)の塩基配列解読を行い、ヒストン修飾に関与するいくつかの遺伝子の変異を同定した。そして、S Seshagiri、C Rudinたちの研究チームは、それぞれの小細胞肺がん腫瘍に由来する原発性小細胞肺がん腫瘍(36例)と小細胞肺がん腫瘍細胞株(17例)のエキソームの塩基配列解読を行った。その結果、キナーゼ、Gタンパク質共役受容体、クロマチン修飾タンパク質をコードする遺伝子など合計22個の遺伝子に有意な変異が見られることが判明した。また、小細胞肺がん検体の27%において、SOX2遺伝子の増幅が見つかった。このことからは、SOX2遺伝子が、小細胞肺がんの発がん遺伝子として重要な役割を果たしていることが示唆されている。

The exomes of 82 small-cell lung cancer samples from patients have been sequenced and analyzed, according to two independent reports published online this week in Nature Genetics. The studies identify several potential targets for therapeutic intervention.

Small-cell lung cancer (SCLC) is an aggressive type of tumor with poor prognosis. This type of cancer is rarely treated by surgery, making systematic genomic analyses of large numbers of tumors difficult. For the first time, two groups have sequenced the exomes from a total of 82 small-cell lung cancer samples and identified new genes recurrently mutated in this type of cancer.

Roman Thomas and colleagues sequenced 29 SCLC exomes and identified mutations in a number of genes involved in histone modification. Somasekar Seshagiri, Charles Rudin and colleagues sequenced the exomes of 36 primary SCLC tumors and 17 SCLC cell lines, individually derived from SCLC tumors. They identified 22 significantly mutated genes, including genes that encode kinases, G-protein coupled receptors and chromatin modifying proteins. They also identified amplification of the SOX2 gene in 27% of samples, suggesting SOX2 has an important role as a cancer-causing gene in small cell lung cancer.

doi: 10.1038/ng.2396

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