古生物学：東アフリカ地溝帯から得られた1800万年にわたる多様なエナメル質プロテオーム
Nature 643, 8072 doi: 10.1038/s41586-025-09040-9
古代DNAおよび古代プロテオミクスによる絶滅タクソンの古生物学的研究は、分子が時間の経過とともに分解されるため鮮新世–更新世の化石にほぼ限定されており、こうした分解は熱帯の環境では増幅される。今回我々は、新生代の哺乳類進化の記録が豊富に得られているケニア・トゥルカナ盆地の、漸新世から更新世の古生物学的な化石産地で発見された一連の化石のエナメル質内部から、小さなプロテオームを得た。我々は、質量分析に基づくプロテオミクスのワークフローを通して、また、エナメル質由来のタンパク質の続成作用を経た形態（diagenetiform）を見つける基準を用いて、Buluk（1600万年前）およびLoperot（1800万年前）で収集された前期中新世のサイ類1個体と複数の長鼻類の化石から、エナメリン、アメロブラスチン、マトリックスメタロプロテアーゼ20、象牙質マトリックス酸性リン酸化タンパク質1（DMP1）の断片を回収した。続成作用を経た形態の数は化石の年代が古くなるにつれて減少しており、これらの化石産地では前期中新世の保存状態にばらつきがあることが観察された。系統発生解析から、絶滅タクソンの系統的な位置付けに対するこれらの配列の寄与が明らかになったが、この手法では、断片の少なさとその種類の不確実さ、そして続成作用の影響を考慮する必要があることを注意すべきである。我々は、これらのタンパク質の年代の古さを裏付ける可能性のある複数の修飾と、これまで知られていなかった終末糖化産物の極めて古い例を複数突き止めた。地球上で最も温暖であり続けている地域の1つにおいて、密なエナメル質組織内にタンパク質配列が発見されたことは、はるかに古いプロテオームの発見を期待させるものであり、これは絶滅タクソンの古生物学的性質や進化的関係の研究に役立つ。
