遺伝学：有袋類と真獣類の胚における分岐したDNAメチル化動態
Nature 642, 8069 doi: 10.1038/s41586-025-08992-2
胎盤を持つ種（真獣類）での重要な研究に基づいて、胚発生には親DNAのメチル化をゲノム規模で消去する必要があるという、哺乳類発生のパラダイムが確立された。ただし、このようなDNAメチル化の再プログラム化が実際に他の哺乳類でも保存されているかどうかは分かっていない。今回我々は、この点を解明するため、有袋類のハイイロジネズミオポッサム（Monodelphis domestica）の配偶子、胚、成体組織について、単一塩基分解能のDNAメチル化マップを作製し、真獣類由来のモデルとの差異を明らかにした。卵母細胞と精子のDNAメチル化レベルの違いは、真獣類のものほど顕著ではなかった。さらに、真獣類のゲノムとは異なり、オポッサムのゲノムは卵割期にも高メチル化を維持していた。胚盤胞では、胚盤葉上層でDNAの脱メチル化が一過性かつ限定的であった。しかし、栄養外胚葉では脱メチル化が持続しており、これは、哺乳類の胎盤でのDNA低メチル化に対して進化に保存された機能があることを示唆している。また、真獣類の場合とは異なり、不活性X染色体は胚発生の間に全体的にDNA低メチル化となった。我々は、配偶子ごとにメチル化状態が異なる領域を特定し、それらは胚で一過的に脱メチル化されるものもあれば維持されるものもあるなど異なる運命をたどり、インプリンティング座位の候補であることを突き止めた。我々はまた、Xist様のノンコーディングRNA RSXの母系DNAメチル化を介して、インプリンティングによるX染色体不活性化を担うと考えられる機構を明らかにした。進化的に分岐した真獣類と有袋類は、胚発生の際にDNA脱メチル化を異なる形で用いていると、我々は結論する。
