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分子生物学：転写因子のDNA結合と調節標的の重複度は低い
Nature 642, 8068 doi: 10.1038/s41586-025-08916-0
DNA塩基配列特異的な転写因子（TF）は真核生物の遺伝子のエンハンサーとプロモーター中の調節部位から働いて、転写とクロマチン構造を調節する。複数のTFが協働して個々の遺伝子を調節する仕組みは、まだ解明されていない。酵母では、ほとんどのTFは上流の活性化塩基配列（調節する遺伝子の数百塩基対上流に位置する）への結合を介して転写を調節すると考えられている。このモデルは、個々のTFと特定の遺伝子については検証されているが、体系的な方法では調べられていない。本研究で我々は、酵母TFのほぼ完全なセットについて結合と発現標的についての情報を統合し、アクチベーターやリプレッサーの役割だけを持つTFは予想に反して少数であり、ほとんどのTFは二重の機能を持つことを示す。ほぼ全てのタンパク質コード遺伝子が1つ、またはそれ以上のTFによって調節されているが、TFの結合と遺伝子調節の間の重複は限られていることが、我々の解析で明らかになった。多数のTFを急速に枯渇させたところ、検出可能なTF結合部位から離れた所にある多数の調節標的が明らかになり、予想外の調節機構の存在が示唆された。本研究は、TF機能の包括的な調査結果を示しており、単一の細胞タイプで発現するTFセット間の相互作用についての手掛かりと、それらが複雑な遺伝子調節プログラムに関与する仕組みを示している。
