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免疫学:ヒトT細胞におけるゲノム規模CRISPRスクリーニングからFOXP3の調節因子が明らかに

Nature 642, 8066 doi: 10.1038/s41586-025-08795-5

制御性T(Treg)細胞は、マスター転写因子FOXP3を特異的に発現し、免疫寛容や恒常性の維持に中心的な役割を担っており、自己免疫疾患に対する細胞療法の革新をもたらす可能性がある。ナイーブCD4+ T細胞をTGFβおよびIL-2の存在下で刺激すると、in vitro誘導型FOXP3+ Treg細胞(iTreg細胞)を誘導することができるが、こうして誘導された細胞は不安定であることが多く、今までのところ臨床応用への障害になっている。Treg細胞の分化を制御する調節ネットワークの解明に向けた体系的手法は、より効果的なiTreg細胞療法につながる可能性がある。今回我々は、ゲノム規模CRISPR機能喪失スクリーニングを行って、初代ヒトT細胞においてFOXP3誘導の遺伝子調節決定因子のカタログを作成し、それらの効果の特徴をPerturb-icCITE-seqを用いて単一細胞レベルで明らかにした。その結果、RBPJ–NCOR抑制因子複合体が、FOXP3発現に対する新規の状況特異的な負の調節因子として見つかった。RBPJを標的とするノックアウトは、カノニカルなNotchシグナル伝達とは独立に、iTreg細胞の分化や機能を増強した。in vitroでサイトカインとT細胞受容体のシグナル伝達刺激を繰り返したところ、RBPJ欠損iTreg細胞は、対照細胞と比べて、FOXP3エンハンサーであるCNS2のDNA脱メチル化を介して、FOXP3発現を増強し、表現型の安定性を高めることが明らかになった。逆に、RBPJを過剰発現させると、HDAC3によるFOXP3のヒストンアセチル化が直接調節され、FOXP3の誘導が強力に抑制された。さらに、RBPJを除去したヒトiTreg細胞は、ヒト化マウスモデルにおいて対照iTreg細胞よりも効率的に異種移植片対宿主病を抑制した。総合的に、我々の知見は、FOXP3の新たな調節因子を明らかにし、自己免疫疾患に対する養子細胞療法の有効性を向上させる新たな道を示している。

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