進化遺伝学：ブラジルのコロンブス以前の時代のゲノムからトレポネーマ症の歴史を見直す

トレポネーマ病の起源は長い間不明であり、特に、ヨーロッパで15世紀後半に最初の梅毒のエピデミックが突然始まったことから、コロンブスの遠征に伴ってアメリカ大陸から到来したという仮説が考えられている。最近、古DNAの証拠から、近世初期ヨーロッパや植民地時代のメキシコで流行したさまざまなトレポネーマ感染症が明らかになっている。しかし、我々の知る限り、南北アメリカ大陸あるいは旧世界から回収された、年代が最初の大西洋を横断する接触以前と確実に推定できるもので、トレポネーマ症の証拠となるゲノムは見つかっていない。今回我々は、ブラジルのほぼ2000年前のヒト遺骸から得られたトレポネーマ症を示すゲノムを示す。コロンブス以前の時代のトレポネーマ症の病原菌の4つの古ゲノムを再構築したところ、これらは、ベジェルの原因病原菌であるTreponema pallidum endemicum（梅毒トレポネーマの亜種）と最も近縁であった。この結果は、ベジェルの現代の地理的ニッチが世界の乾燥地域であることに矛盾しており、梅毒トレポネーマ亜種のこれまでの古病理学的特徴付けに疑問を投げ掛けるとともに、これらの病原菌の適応能力を示している。高カバー率のゲノムを用いることで、分子時計の年代推定が改善され、現代の梅毒トレポネーマ亜種の分岐がコロンブス以前の時代に確実に位置付けられた。まとめると我々の研究は、病原菌の進化と出現における重要な事象を明らかにするための考古遺伝学の機会を実証しており、トレポネーマ症の起源と伝播に関する新しい仮説への道を開く。

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