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免疫学:胸腺間質の単一細胞マッピングによるIL-25を産生する上皮刷子細胞の特定

Nature 559, 7715 doi: 10.1038/s41586-018-0346-1

T細胞の発生と選択は、胸腺において、さまざまなストローマ細胞集団からなる特殊化したニッチによって調整される。胸腺の間質区画の異なるタイプの細胞の機能の特定には、長年にわたって大きな進展が見られるが、それらの細胞の多様性や不均一性について、包括的な特徴付けは行われていない。今回我々は、大規模並行単一細胞RNA塩基配列解読(massively parallel single-cell RNA-sequencing)、空間マッピング、クロマチンプロファイリング、遺伝子ターゲッティングを組み合わせて、マウス胸腺の全間質区画のde novo特徴付けを行った。その結果、多数の細胞状態が突き止められ、胸腺上皮細胞(TEC)で不均一性の度合いが最も高いことが分かった。我々の解析から、異なる分子機能、エピジェネティックな全体像、細胞系譜調節因子を示す4つの主要な髄質TEC(mTEC I–IV)集団が明らかになった。特に、mTEC IVは新規かつ他とは極めて異なるTEC細胞系譜を構成していて、腸における化学受容性の上皮刷子(タフト)細胞の分子的特徴を持っていた。刷子細胞のマスター調節因子であるPou2f3を欠損したマウスは、mTEC IV細胞を特異的かつ完全に喪失しており、その結果、胸腺に常在する2型自然リンパ球のレベルが上昇していた。まとめると、我々の研究は、胸腺間質の包括的な特徴付けを提供するものであり、また、胸腺の免疫ニッチを形作るのに重要な新しい刷子細胞様TEC集団を特定している。

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