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微生物生態学：低所得者居住地の相互につながったマイクロバイオームとレジストーム
Nature 533, 7602 doi: 10.1038/nature17672
抗生物質耐性菌感染症は、毎年世界中で数十万人の命を奪っている。この問題は、さまざまな居住地の病原性微生物と無害微生物との間で耐性遺伝子が交換されることによって悪化している。ヒトと環境との間の耐性遺伝子の伝播をマッピングすることは、公衆衛生上の優先課題である。今回我々は、ラテンアメリカの2つの低所得コミュニティーから得た相互につながりのあるヒト糞便試料と環境試料数百点の細菌群集構造および耐性交換ネットワークの特徴を明らかにした。我々は、居住地全体のレジストームは一般に生態学的勾配に沿って細菌の系統によって構成されていることを見いだしたが、居住地の境界をまたぐ重要な耐性遺伝子を明らかにして、可動性遺伝因子との関係を特定した。我々は、低・中所得国を代表するこうした環境で、糞便細菌および耐性遺伝子の低減に広く利用されている排泄物管理戦略の有効性も評価した。今回の結果は、世界人口の3分の2超を代表する環境における相互につながりのある居住地全体にわたって耐性遺伝子伝播の定量的リスク評価および監視を行うための基礎を築くものである。
