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がん:CLLおよびそのプログレッションと再発の進化を駆動する変異群
Nature 526, 7574 doi: 10.1038/nature15395
どの遺伝的変化が腫瘍発生を促進するのか、そして疾患の進行と治療の過程を通してそれがどのように進化していくのかは、がん生物学の重要な問題である。今回我々は、538例の慢性リンパ性白血病(CLL)と対応する生殖細胞系列DNA試料(そのうち278例は前向き臨床試験で収集されたもの)の全エキソーム塩基配列解読によって、44の頻繁に変異する遺伝子と11の頻発する体細胞性コピー数多型を明らかにする。これらには、以前に認識されていなかった推定がんドライバー(RPS15、IKZF3)が含まれ、全体として、RNAプロセシングと搬出、MYC活性、そしてMAPKシグナル伝達がCLLに関与する中心的経路であることが明らかになった。この大規模データセットのクローナリティー解析によってさらに、ドライバー事象間の時間的関係の再構築が可能になった。59人の患者の治療前と再発後の対応した試料間の直接比較から、非常に頻繁なクローン進化が証明された。従って、臨床的に有益な試料の膨大な塩基配列解読データセットにより、がんに関連する新規遺伝子、ドライバー事象間の関連性のネットワーク、および疾患の再発と臨床転帰に対するそれらの影響を明らかにできる。

