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Editorials

中国の再生可能エネルギー業界が不振に陥っているが、そこから、立ち直りに向けての多くの教訓が得られるはずだ。

Power cuts

doi: 10.1038/490005b

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米原子力規制委員会(NRC)がウラン濃縮の新技術を認可したが、核拡散問題を考えると望ましい方向ではない。

The price of progress

doi: 10.1038/490005a

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アラバマ大学乱射事件の裁判で、被害者、遺族の温情により、死刑判決が回避された。

Life sciences

doi: 10.1038/490006a

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News

南アフリカに新設された研究センターが、薬剤耐性結核との闘いの最前線に。

Foundation opens TB lab in Africa

doi: 10.1038/490019a

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生命科学分野の論文撤回の主な原因は、不正行為であることが明らかに。

Misconduct is the main cause of life-sciences retractions

doi: 10.1038/490021a

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マラリア治療薬購入促進機関(AMFm)として知られる計画が、データ不足などの批判を浴び、中断の危機に。

Malaria plan under scrutiny

doi: 10.1038/490013a

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NASAが、米国家偵察局から譲られた2個の偵察衛星の利用方法を検討へ。

The telescopes that came in from the cold

doi: 10.1038/490016a

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新たに出現したSARS類似ウイルスに、専門家がすばやい対応を。

SARS veterans tackle coronavirus

doi: 10.1038/490020a

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忘れられた過去の薬を、ほかの疾患の新しい治療薬として活用するという試みが。

New cures sought from old drugs

doi: 10.1038/490015a

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News Features

天体物理学:新しい銀河

The New Milky Way

銀河の新たな観測結果によって、混沌としたその誕生から苛酷な最期に至る道筋が見えてきた。

doi: 10.1038/490024a

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植物科学:クリの木の再生

The chestnut resurrection

かつて米国東部の森林の中心だったアメリカグリは胴枯れ病で壊滅したが、その再生への試みが進んでいる。

doi: 10.1038/490022a

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News & Views

フォーラム:気候科学:エアロゾルの影響

Climate science: The aerosol effect p.40

大気中に存在する人為起源のエアロゾルが、気候に影響を与えるのは確実だ。だが、エアロゾルの影響を説明するために気候モデルで使われている手法は、エアロゾルの影響について意味のある推定値を与えるものだろうか。2人の気候科学研究者が見解を述べている。

doi: 10.1038/490040a

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粘膜免疫学:感染が常在細菌への攻撃を誘発する

Mucosal immunology: Infection induces friendly fire p.41

我々の免疫系は通常、「友好的な」腸内細菌を無視している。だが、病原体による感染が腸内表面の粘膜に損傷を与えると、常在細菌は体内に侵入できるようになり、自身に対する免疫応答を引き起こす。

doi: 10.1038/490041a

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量子物理学:キュービットのための巡航制御

Quantum physics: Cruise control for a qubit p.43

システムの監視とその動態の調整、つまり連続的なフィードバック制御は、システムを「軌道に乗せておく」ために広く使われている。この方法が今回、量子ビットの循環をほぼ無期限に維持するのに使われた。

doi: 10.1038/490043a

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ゲノミクス:居住者のリスク

Genomics: Resident risks p.44

ヒトの腸に棲み着いている微生物からなる膨大な群集のゲノムを調べるための革新的な手法によって、2型糖尿病のリスク因子を明らかにする新たな方法が得られた。

doi: 10.1038/490044a

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宇宙物理学:1つの星団中に見つかった2つのブラックホール

Astrophysics: Two black holes found in a star cluster p.46

天の川銀河中の密度の高い恒星系で2つのブラックホール候補が見つかったことは、このような天体のもっと大きな集団がこの恒星系内に隠れている可能性を示している。

doi: 10.1038/490046a

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免疫学:妊娠を許容する

Immunology: Tolerating pregnancy p.47

妊娠した女性の免疫系が胎児の持つ父親由来の抗原に寛容となる仕組みが、特異的な抑制性免疫細胞の活性(その一部は維持されて、それ以降の妊娠に役立つ)によって説明されることがわかった。

doi: 10.1038/490047a

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Articles

遺伝:カキのゲノムから、ストレス適応と殻の形成の複雑さが判明

The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation p.49

The Pacific oyster Crassostrea gigas belongs to one of the most species-rich but genomically poorly explored phyla, the Mollusca. Here we report the sequencing and assembly of the oyster genome using short reads and a fosmid-pooling strategy, along with transcriptomes of development and stress response and the proteome of the shell. The oyster genome is highly polymorphic and rich in repetitive sequences, with some transposable elements still actively shaping variation. Transcriptome studies reveal an extensive set of genes responding to environmental stress. The expansion of genes coding for heat shock protein 70 and inhibitors of apoptosis is probably central to the oyster’s adaptation to sessile life in the highly stressful intertidal zone. Our analyses also show that shell formation in molluscs is more complex than currently understood and involves extensive participation of cells and their exosomes. The oyster genome sequence fills a void in our understanding of the Lophotrochozoa.

doi: 10.1038/nature11413

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医学:2型糖尿病患者の腸内微生物相に関する全メタゲノム関連研究

A metagenome-wide association study of gut microbiota in type 2 diabetes p.55

Assessment and characterization of gut microbiota has become a major research area in human disease, including type 2 diabetes, the most prevalent endocrine disease worldwide. To carry out analysis on gut microbial content in patients with type 2 diabetes, we developed a protocol for a metagenome-wide association study (MGWAS) and undertook a two-stage MGWAS based on deep shotgun sequencing of the gut microbial DNA from 345 Chinese individuals. We identified and validated approximately 60,000 type-2-diabetes-associated markers and established the concept of a metagenomic linkage group, enabling taxonomic species-level analyses. MGWAS analysis showed that patients with type 2 diabetes were characterized by a moderate degree of gut microbial dysbiosis, a decrease in the abundance of some universal butyrate-producing bacteria and an increase in various opportunistic pathogens, as well as an enrichment of other microbial functions conferring sulphate reduction and oxidative stress resistance. An analysis of 23 additional individuals demonstrated that these gut microbial markers might be useful for classifying type 2 diabetes.

doi: 10.1038/nature11450

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医学:ヒト乳がんの包括的な分子ポートレート

Comprehensive molecular portraits of human breast tumours p.61

We analysed primary breast cancers by genomic DNA copy number arrays, DNA methylation, exome sequencing, messenger RNA arrays, microRNA sequencing and reverse-phase protein arrays. Our ability to integrate information across platforms provided key insights into previously defined gene expression subtypes and demonstrated the existence of four main breast cancer classes when combining data from five platforms, each of which shows significant molecular heterogeneity. Somatic mutations in only three genes (TP53, PIK3CA and GATA3) occurred at >10% incidence across all breast cancers; however, there were numerous subtype-associated and novel gene mutations including the enrichment of specific mutations in GATA3, PIK3CA and MAP3K1 with the luminal A subtype. We identified two novel protein-expression-defined subgroups, possibly produced by stromal/microenvironmental elements, and integrated analyses identified specific signalling pathways dominant in each molecular subtype including a HER2/phosphorylated HER2/EGFR/phosphorylated EGFR signature within the HER2-enriched expression subtype. Comparison of basal-like breast tumours with high-grade serous ovarian tumours showed many molecular commonalities, indicating a related aetiology and similar therapeutic opportunities. The biological finding of the four main breast cancer subtypes caused by different subsets of genetic and epigenetic abnormalities raises the hypothesis that much of the clinically observable plasticity and heterogeneity occurs within, and not across, these major biological subtypes of breast cancer.

doi: 10.1038/nature11412

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Letters

宇宙:球状星団 M22 内の2つの恒星質量ブラックホール

Two stellar-mass black holes in the globular cluster M22 p.71

doi: 10.1038/nature11490

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宇宙:系外原始カイパーベルト内のカンラン石結晶の彗星に似た鉱物学的特性

Comet-like mineralogy of olivine crystals in an extrasolar proto-Kuiper belt p.74

doi: 10.1038/nature11469

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物理:量子フィードバックを用いた超伝導キュービットにおけるラビ振動の安定化

Stabilizing Rabi oscillations in a superconducting qubit using quantum feedback p.77

doi: 10.1038/nature11505

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気候:南極内陸における過去30万年間の硫酸塩エアロゾルと気候のカップリング

Sulphate–climate coupling over the past 300,000 years in inland Antarctica p.81

doi: 10.1038/nature11359

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地球:過去2000年間のメタン源の自然変動と人為的変動

Natural and anthropogenic variations in methane sources during the past two millennia p.85

doi: 10.1038/nature11461

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地球:地球磁場逆転の力学的類似性

Dynamical similarity of geomagnetic field reversals p.89

doi: 10.1038/nature11491

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進化:殻を持つシルル紀の無板類と、軟体動物の系統発生に持つ意味

A Silurian armoured aplacophoran and implications for molluscan phylogeny p.94

doi: 10.1038/nature11328

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進化:植物胚発生におけるトランスクリプトームの砂時計

A transcriptomic hourglass in plant embryogenesis p.98

doi: 10.1038/nature11394

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免疫:妊娠は胎児の抗原に対してアネルギーを維持する制御性記憶を刷り込む

Pregnancy imprints regulatory memory that sustains anergy to fetal antigen p.102

doi: 10.1038/nature11462

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免疫:インフラマソームによる炎症性脂質メディエーターのin vivoでの迅速な誘導

Rapid induction of inflammatory lipid mediators by the inflammasome in vivo p.107

doi: 10.1038/nature11351

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遺伝:ショウジョウバエにおけるパラミューテーションはpiRNAを産生する遺伝子座の出現と関連する

Paramutation in Drosophila linked to emergence of a piRNA-producing locus p.112

doi: 10.1038/nature11416

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医学:構造ゲノミクスおよび機能ゲノミクスに基づくバーキットリンパ腫の病因と治療標的

Burkitt lymphoma pathogenesis and therapeutic targets from structural and functional genomics p.116

doi: 10.1038/nature11378

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細胞:DEADボックスヘリカーゼMss116pによるRNA二本鎖の認識と巻き戻しの構造基盤

Structural basis for RNA-duplex recognition and unwinding by the DEAD-box helicase Mss116p p.121

doi: 10.1038/nature11402

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構造生物学:ベタイン輸送体BetPの非対称なコンホメーションを持つ三量体で見られる交互アクセス機構

Alternating-access mechanism in conformationally asymmetric trimers of the betaine transporter BetP p.126

doi: 10.1038/nature11403

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