Letter 構造生物学：多数同時参加型オンラインゲームを使ったタンパク質の構造予測 2010年8月5日 Nature 466, 7307 doi: 10.1038/nature09304 人はコンピューターゲームをする際に、多くの問題解決努力をしている。簡単な画像や文字列の認識作業については、ゲームを介した「クラウドソーシング」がうまくいくことがわかっているが、もっと複雑な科学問題が「人の教示に基づく」計算的方法によって解決できるかどうかは不明である。タンパク質の構造予測は、このような問題の1つである。あるタンパク質の、生物学的に適切な本来のコンホメーションの特定は、探索空間が極めて大きくなることを考えると、非常に困難な計算課題であるといえる。本論文では、専門知識のない参加者が、困難な構造予測問題の解決に取り組む多人数参加型オンラインゲームFolditについて報告する。Folditの参加者は、直接操作ツールとRosetta構造予測法のアルゴリズムのユーザーフレンドリー版を使って、タンパク質の構造を操作しながら、競争したり、協力し合ったりして、計算されたエネルギーの最適化を図る。Foldit参加者中の最上級者たちは、疎水性残基を埋め込むためにかなりの骨格再編成が必要になるような、非常に難しい構造精密化問題の解決に優れた能力を示すことがわかった。参加者たちは協力し合って、さまざまな優れた新しい戦略、アルゴリズムを開発した。計算論的手法の場合とは異なり、参加者たちはコンホメーション空間だけでなく、使用可能な探索戦略の空間についても調べた。対話型の多人数参加型オンラインゲームを介して、ヒトの視覚的問題解決能力と戦略開発能力と従来型の計算アルゴリズムとを結びつけるこの方法は、計算的手法だけでは限界のある科学的問題を解決するための強力な新手法である。 Full Text PDF 目次へ戻る
