哺乳類では、父親由来と母親由来の対立遺伝子間にみられるDNAメチル化の差異によって、両親に由来するインプリントをもつ遺伝子の起源特異的な発現が調節されている。メチル化インプリントは、雄性および雌性生殖細胞で配偶子形成時に確立されるが、この過程にはde novo DNAメチルトランスフェラーゼDNMT3Aとその補因子DNMT3Lが必要である。しかし、生殖系列のインプリンティングにおける、de novo DNAメチル化装置の遺伝子座特異的および親特異的標的化の基盤となる機序についてはよくわかっていない。今回我々は、リシンデメチラーゼKDM1（LSD1としても知られる）に近縁のタンパク質であるAOF1（amine oxidase (flavin-containing) domain 1）は、ヒストンH3リシン4（H3K4）デメチラーゼとして機能し、卵母細胞のインプリントされた遺伝子の一部のde novo DNAメチル化に必要であることを示す。新命名法に従って現在ではリシンデメチラーゼ1B（KDM1B）と改称されているAOF1は、ゲノムインプリンティングが確立されている成長中の卵母細胞で高度に発現している。KDM1Bをコードする遺伝子の標的破壊は、マウスの発生および卵形成に影響を及ぼさなかった。しかし、KDM1Bを欠損する雌マウスから得られた卵母細胞は、H3K4のメチル化がかなり増加し、調べた7つのインプリントされた遺伝子のうちの4つで、DNAメチル化マークの設定に失敗した。これらの卵母細胞に由来する胚は、影響を受けた遺伝子の両対立遺伝子発現または両対立遺伝子抑制がみられ、妊娠中期以前に死亡した。今回の結果は、卵形成時のDNAメチル化インプリンティングの確立には、H3K4の脱メチル化が極めて重要であることを示唆している。
