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医学:合成致死スクリーニングによる癌細胞の化学物質増感遺伝子座の同定

Nature 446, 7137 doi: 10.1038/nature05697

多くの証拠から、癌の分子病理を支配する統一原則は、増殖の促進とアポトーシスの抑制を引き起こす中心的機構の共依存的な異常制御が起こることだと考えられている。この腫瘍化を促進する制御環境を支える異常タンパク質は、異種細胞が混じり合った癌細胞集団における最適な治療介入標的となる可能性が高いと思われる。RNA干渉法(RNAi)に基づく機能ゲノミクスの登場により、機構的関係についての先入観にとらわれず、重要な生物系を支えていることが確認されている遺伝子標的を不偏的かつ包括的に収集する機会が得られるようになった。我々は、細胞ベースの1ウェル/1遺伝子のハイスループット・スクリーニング・プラットフォームと、化学合成低分子干渉RNAのゲノム全体にわたる合成ライブラリーとを組み合わせて、癌細胞の化学物質反応性の分子的基盤について体系的にデータ収集を行った。ヒトの非小細胞肺癌株NCI-H1155を用いて、本来は致死量以下のパクリタキセル濃度で特異的に細胞の生存能力を低下させる遺伝子標的を同定するためにデザインされたパクリタキセル依存性合成致死スクリーニングを行った。過誤発見率を5%未満に抑えるために厳格な客観的統計アルゴリズムを用い、我々は、微小管動態の欠損に対する癌細胞の自律的反応の主要な部分を表す87個の遺伝子パネルを単離した。本論文では、これらの標的のいくつかは、有意な反応を起こさせるのに必要なパクリタキセル濃度の1,000分の1未満にまで肺癌細胞の感受性を増大させることを示し、癌に関連する異常な遺伝子発現プログラムと有系分裂の確実な進行に必要とされる基本的な細胞装置との間の機構的な関係を明らかにする。

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