Article Nova依存性スプライシング調節の存在を予測するRNAマップ 2006年11月30日 Nature 444, 7119 doi: 10.1038/nature05304 Novaタンパク質は、ニューロン特異的な選択的スプライシング因子である。我々は、バイオインフォマティクス、生化学および遺伝学的知識を組み合わせ、Novaタンパク質が選択的スプライシングを調節する際の規則を記述するRNAマップを作成した。このマップにより、プレメッセンジャーRNA中のNova結合部位（YCAYクラスター）の位置が、スプライシングの結果を決めることが明らかになった。このマップは、エキソンの組み入れを抑制するか、それとも促進するかというNovaの働きを正確に予測していたので、我々はこのマップとNovaの作用機序との関係を調べた。エキソンYCAYクラスターへのNovaの結合は、プレmRNA上で組み立てられるタンパク質複合体を変化させてU1 snRNP（核内低分子リボ核タンパク質）の結合とエキソンの組み入れを妨害するが、イントロンYCAYクラスターへのNovaの結合は、スプライソソームの構築およびエキソンの組み入れを促進する。マウス脳で、Novaに調節される転写物のスプライシング中間体を分析することにより、NovaがYCAYクラスターを内包する（または最も近接する）イントロンの除去を優先的に調節することが明らかになった。今回の結果は、シス作用性因子の位置とRNA結合タンパク質によるその因子の調節とを関連づけたゲノム規模のマップを明らかにしたものであり、すなわち、NovaのYCAYクラスターへの結合が局所的・非対称的作用をもたらして、ニューロンにおけるスプライソソームの構築と選択的スプライシングを調節することを明確に示している。 Full Text PDF 目次へ戻る
