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遺伝:概日周期の主観的夜における遺伝子発現にかかわる転写因子応答配列

Nature 418, 6897 doi: 10.1038/nature00906

哺乳類の概日時計は複雑に統合されたフィードバックループから構成されており、これを解明するためには系の動態を包括的に測定してネットワークの構造を明らかにする必要がある。今回、このような複雑な系を詳しく分析するためにゲノム生物学、分子生物学、細胞生物学の手法に基づくシステム生物学的手法を採用し、視交叉上核と肝臓におけるゲノムワイドな遺伝子発現パターンの変化を明暗周期および恒暗条件下で調べた。新たに同定された時計関連遺伝子群のヒト相同遺伝子の転写開始点を決定し、次にバイオインフォマティクスによって時期特異的な発現と転写開始点周囲にある転写因子応答配列との関連を調べた。ここでは、Rev-ErbA/ROR応答配列が概日周期の主観的夜における遺伝子発現(Bmal1遺伝子の振動と同位相で、Per2遺伝子の振動とは逆位相の遺伝子発現)に重要な役割を果たすことを報告する。この役割を、概日時計の制御を受けるレポーターベクターを培養繊維芽細胞に一時的に導入するin vitro検証系を用いて細胞に安定な生物発光の概日振動を誘導することで立証した。

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