ネアンデルタール人と初期人類との交雑が評価された
Nature Ecology & Evolution
Neanderthal–early human interbreeding assessed
現代の東アジア人とヨーロッパ人において、ネアンデルタール人のDNA断片の大規模な遺伝子解析が行われ、解剖学的現生人類の祖先とネアンデルタール人が複数の時点で確かに交雑していたことを明らかにした論文が、今週掲載される。
アフリカから拡散した解剖学的現生人類は、ユーラシア西部でネアンデルタール人と遭遇した。この遭遇は、現代の非アフリカ人集団のゲノムに痕跡を残した。解剖学的現生人類のゲノムには、ネアンデルタール人の要素が約2％含まれているのである。当初、現生人類とネアンデルタール人との間の交雑事象は1回だけであったと考えられていたが、東アジア人においてネアンデルタール人祖先の割合が、ヨーロッパ人よりも12～20％高いという知見から、遭遇は複数回であった可能性が示唆されていた。
Fernando VillaneaとJoshua Schraiberは、現生人類ゲノムの大規模なデータセットにおいて、東アジア系の人々とヨーロッパ系の人々の、ネアンデルタール人由来DNAのパターンに見られる非対称性を分析した。そして、異なる回数の交雑事象に関して解剖学的現生人類のゲノムに対するネアンデルタール人DNAの寄与をシミュレーションし、これらのパラメーターの多い複雑なモデルを機械学習の手法を用いて検討した。その結果、現生人類ゲノムに見られたネアンデルタール人由来DNAのパターンは、ネアンデルタール人集団と、東アジア人集団とヨーロッパ人集団の両方との間の複数回の交雑事象によって最もよく説明される、と結論付けられた。
著者たちは、現生人類とネアンデルタール人との複数回の遭遇は、異なるヒト族集団の間でたびたび複雑な相互作用が生じていたという新たな見方に符合する、と結んでいる。
Neanderthals and ancestors of anatomically modern humans did interbreed at multiple points in time, according to the large-scale genetic analyses of Neanderthal DNA fragments in contemporary East Asians and Europeans published this week in Nature Ecology & Evolution.
When anatomically modern humans dispersed from Africa, they encountered Neanderthals in western Eurasia. These encounters left a signature in the genomes of contemporary non-African populations: about 2% of their genomes include a Neanderthal component. Initially, it was assumed that only a single episode of interbreeding between modern humans and Neanderthals occurred, but the observation that the proportion of Neanderthal ancestry is 12-20% higher in East Asian individuals relative to Europeans suggested the possibility of multiple encounters.
Fernando Villanea and Joshua Schraiber analysed the asymmetry in the patterns of DNA of Neanderthal origin between individuals of East Asian and European ancestry in a large dataset of modern human genomes. The authors then simulated contributions of Neanderthal DNA to the genomes of anatomically modern humans for different numbers of interbreeding events and used a machine learning approach to explore these complex models with many parameters. They conclude that the observed patterns of DNA of Neanderthal origin in modern human genomes are best explained by not one but multiple episodes of interbreeding between Neanderthal and both East Asian and European populations.
The authors conclude that multiple episodes of modern human–Neanderthal encounters fit with the emerging view of complex and frequent interactions between different hominin groups.
doi: 10.1038/s41559-018-0735-8
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