Research press release


Nature Ecology & Evolution

Rooting around in the truffle genome



Francis Martinたちは今回、珍重されているピエモンテ・白トリュフ(Tuber magnatum)とバーガンディー・トリュフ(Tuber aestivum)に加え、砂漠トリュフ(Terfezia boudieri)と豚トリュフ(Choiromyces venosus)のゲノムの塩基配列を解読した。これらのゲノムを、既知のペリゴール・黒トリュフ(Tuber melanosporum)やトリュフを作らない菌類のゲノムと比較した結果、トリュフ種は分岐してから数億年にわたって別々に進化してきたにもかかわらず、種間で予想外の遺伝的類似性が見いだされた。例えば、植物との共生や、土壌から栄養素を取り込む能力に関係する遺伝子が共通していた。また、トリュフ種では、共生する植物細胞壁の分解に他の菌類が用いている遺伝子群が限られていることも明らかになった。一方でトリュフ種は、香り高い揮発性有機化合物を産生する遺伝子の豊富なレパートリーを有しており、動物(ブタやトリュフ犬など)を誘引する刺激的な芳香を発してトリュフの胞子を散布させている。

この研究は、「1000 Fungal Genomes Project」の一環として行われたものであり、このプロジェクトでは、5年以内に菌類1000種のゲノム塩基配列を解読して、系統樹上最大級の枝に関する理解の空白を埋めることを目指している。

The genomes of four truffle species are reported in a paper published online this week in Nature Ecology & Evolution. These findings reveal the genetic underpinnings of one of the world’s most aromatic and expensive foods.

Truffles are the spore-filled, fruiting bodies of fungi that grow on plant roots. Truffle-forming species have evolved independently more than a hundred times, appearing in nearly every major group of fleshy fungi; however, fundamental questions about the evolution of the truffle lifestyle remain.

Francis Martin and colleagues sequenced the genomes of the prized Piedmont white truffle and the Burgundy, desert and pig truffles. The authors compared these genomes with the Périgord black truffle and non-truffle-forming fungi and uncover unexpected genetic similarities among the truffle species, despite their separate evolutionary paths since their divergence over hundreds of millions of years. For example, they find shared genes relating to truffles’ symbiosis with plants and their ability to derive nutrients from the soil. They also find that truffles have a limited set of the genes that allow other fungi to specialize in breaking down the cell walls of the plants on which they live. Instead, truffles have a wider repertoire of genes that produce smelly volatile organic compounds, generating the pungent aroma that attracts animals (such as pigs and truffle dogs) to disperse the truffle’s spores.

This study is part of the 1000 Fungal Genomes Project - a five-year initiative intended to fill the gaps in our understanding of one of the largest branches in the tree of life.

doi: 10.1038/s41559-018-0710-4

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