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遺伝子調節:ディープラーニングによるシス調節のための文法の解読

Nature Genetics 53, 3 doi: 10.1038/s41588-021-00814-1

今回、高分解能のChIP–nexusデータから、転写因子の結合に関する構文を解明するための新たなディープラーニング手法が構築された。in silicoでのシミュレーション結果によって、配列に基づいた複雑な予測が実験的に検証され、転写因子の結合にはDNAらせんの周期性が関与することや、転写因子間の協調には方向性があることが確認された。

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