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肺がん:肺の腺がんと扁平上皮細胞がんでは体細胞ゲノム変化のパターンが異なる

Nature Genetics 48, 6 doi: 10.1038/ng.3564

肺の腺がん(ADC)と肺の扁平上皮細胞がん(SqCC)を比較して、新しい肺の発がんドライバーを同定するために、肺のADC腫瘍と正常組織の660組、および肺のSqCC腫瘍と正常組織の484組について、エキソーム塩基配列とコピー数のプロファイルを調べた。肺のSqCCに頻発する変化は、肺のADCにおける変化よりも、他の扁平上皮がんの変化に類似していた。有意に変異が見られる新しい遺伝子には、肺のADCではPPP3CADOT1LFTSJD1、肺のSqCCではRASA1、その両方の腫瘍ではKLF5EP300CREBBPが含まれていた。新しく見られた増幅ピークには、肺のADCではMIR21、肺のSqCCではMIR205、その両方の腫瘍ではMAPK1が含まれていた。受容体型チロシンキナーゼ-Ras-Raf経路の変化が見られない肺のADCでは、SOS1VAV1RASA1ARHGAP35に変異が起こっていた。変異に由来する新生抗原については、肺のADC腫瘍の47%および肺のSqCC腫瘍の53%に、少なくとも5個の予測新生抗原が見つかった。肺のADCおよびSqCCに対する標的療法は大きく異なっているが、免疫治療が両サブタイプの治療に役立つ可能性が示唆された。

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