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コピー数多型:ヒト多能性幹細胞における7q11.23の遺伝子量依存性脱調節は、疾患関連細胞系統で転写プログラムに影響を及ぼす

Nature Genetics 47, 2 doi: 10.1038/ng.3169

細胞の再プログラム化により、発生に関連するヒト細胞系統において遺伝子型から表現型への橋渡しが可能になることで、ヒトの遺伝的多様性が健康および病気に与える影響の特徴が実験的に追跡できるようになることが期待される。本論文では、この枠組みを7q11.23領域の欠失と重複という対称的なコピー数多型によって引き起こされる2つの病気(ウイリアムス・ボイレン症候群と7q微小重複症候群。これらの疾患は共通の表現型と対称的な逆の表現型という顕著な組み合わせを持つ)に適用した。再プログラム化のための導入遺伝子の挿入がない方法で作製された患者由来の誘導多能性幹細胞、およびそれらを分化させた細胞の解析から、7q11.23の遺伝子量の不均衡が多能性状態の開始から疾患に関連する経路において転写回路を障害することが分かった。このような障害は、多能性細胞が疾患に関連する細胞系統へ分化する際に選択的に増幅される。この転写の脱調節のかなりの部分は、特にGTF2Iの遺伝子量不均衡によって引き起こされる。GTF2Iは、7q11.23で主要な転写因子をコードしており、抑制性のLSD1クロマチン複合体と会合して、GTF2Iの遺伝子量感受性の標的を抑制するように働く。

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